產品介紹
“單細胞級別”的空間蛋白質組學，技術的核心在于使用高精度激光捕獲顯微切割技術（LCM）來切取感興趣的組織區域或細胞，然后通過優化的超微量樣本無損提取并酶切蛋白為肽段，最后利用高靈敏度質譜分析不同空間位置上的蛋白表達情況，對組織區域或特定細胞類型的精確識別，為研究細胞空間異質性、揭示細胞微環境的復雜性提供了強有力的工具，有助于大家理解疾病機制和發現新的生物標志物。
技術優勢
? 超高空間精度：切割區域可精確到單細胞，極致保留空間異質性，精準捕捉單細胞水平蛋白表達差異
? 精準特異：LCM 精準分離目標區域，結合 LC-MS 減少干擾，結果精準可靠
? 高敏低限：可檢測低豐度蛋白，適配微量 / 疾病早期樣本，助力標志物發現
? 空間 - 定量融合：兼具空間分辨率與精確定量能力，解析組織異質性
? 兼容擴展：可聯動多組學及生物信息學工具，挖掘深層生物學信息
? 樣本適用廣：適配 FFPE、冰凍切片等多種樣本類型
樣本要求
? 組織塊：FFPE組織塊、OCT包埋冰凍組織塊
? 切片：FFPE切片、OCT切片（冰凍切片）
? FFPE類樣本冰袋運輸、OCT類樣本干冰運輸
檢測平臺
timsTOF Pro2, Bruker
應用方向
? 腫瘤研究：解析腫瘤微環境細胞互作與信號通路，研究腫瘤異質性以指導個體化治療，探索腫瘤發生發展機制并發現早期標志物
? 疾病診斷與預后：發現疾病特異性標志物，實現疾病精細分型與預后判斷，助力精準治療
? 組織器官圖譜構建：繪制正常/疾病組織空間蛋白質組圖譜，揭示組織生理功能與病理分子特征
? 藥物研發與靶點發現：闡明藥物作用機制，預測療效并解析耐藥機制，優化藥物設計與聯合用藥方案
? 細胞與發育生物學：研究細胞器功能與細胞信號傳導機制，追蹤胚胎發育蛋白表達變化，揭示細胞分化與器官形成規律
? 感染與免疫研究：解析病原體感染與免疫逃逸機制，研究免疫細胞活化與調控規律，助力抗感染藥物與免疫治療研發
案例應用
英文標題：Clinical functional proteomics of intercellular signalling in pancreatic cancer
發表期刊：Nature
影響因子：48.5
技術方法：空間蛋白質組學
研究內容：該研究開發了多維度臨床功能蛋白質組學策略 TMEPro，對 100 例人胰腺組織樣本的分泌與膜蛋白開展深度、空間、時間、酪氨酸磷酸化及膜蛋白胞外區脫落分析，系統解析胰腺癌腫瘤微環境（TME）中癌細胞與基質細胞的細胞間信號網絡，構建 1600 余種關鍵信號軸；揭示基質 PDGFR - PTPN11 - FOS 信號軸介導的雙向細胞互作環路，發現基質金屬蛋白酶介導的 AXL 受體胞外域脫落可調控細胞間信號，且 AXL 脫落水平與淋巴結轉移相關，聯合抑制 AXL 脫落與激酶活性能協同抑制癌細胞生長，為胰腺癌診療提供新靶點與標志物線索。
Fig.基于空間蛋白質組學進行特異性蛋白質組分析
英文標題：Deep spatial proteomics reveals region-specific features of severe COVID-19-related pulmonary injury
發表期刊：Cell Reports
影響因子：6.9
技術方法：空間蛋白質組學
研究內容：COVID-19（由SARS-CoV-2引起）對公共衛生構成嚴重的威脅，盡管已經有疫苗和靶向藥物的開發，但對重癥病例的治療方案仍然不足。本研究旨在深入探究新冠肺炎導致肺部損傷的蛋白質基礎，并通過高分辨率的空間蛋白組學方法揭示其分子機制。研究人員結合激光顯微切割成像技術和超高靈敏度蛋白質組學技術，對COVID-19患者的肺部組織中的三個基本結構（即肺泡上皮（AE）、支氣管上皮（BE）和血管（VE））以及四個病理改變區域（支氣管粘液栓（BMP）、肺部纖維化（PF）、肺泡內炎性細胞浸潤（ASI）和增生性ll型肺泡細胞（HAT2））進行了分析，并鑒定出超過10,000種蛋白質，同時與非COVID-19對照組進行比較分析，揭示了COVID-19患者肺部組織中存在的多種蛋白質表達水平變化和功能異常，為COVID-19的治療提供了重要的參考依據。
Fig.本研究機制圖解
空間蛋白質組學綜合解決方案，數據分析軟件，質譜檢測技術及介紹，全面的聯用技術等。
