- 非靶標(biāo)代謝組學(xué)
- 脂質(zhì)組學(xué)
- 高通量靶標(biāo)代謝組學(xué)
- 多組學(xué)
-
蛋白質(zhì)組學(xué)
- 血清蛋白冠-DIA
- iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組研究
- 定性鑒定蛋白質(zhì)組學(xué)
- 多肽組學(xué)
- PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué)
- 磷酸化修飾DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- 乙酰化修飾DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- 泛素化修飾DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- 糖基化修飾DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- MetPro-Ⅱ代謝物與蛋白相互作用
- 4D-Label free非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組研究
- 蛋白冠-DIA
- DIA微量蛋白質(zhì)組
- Olink蛋白質(zhì)組學(xué)
- 乳酸化修飾DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- 琥珀酰化修飾DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- 軟件及儀器
- 單細(xì)胞&時(shí)空組學(xué)
產(chǎn)品介紹
原核有參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是針對(duì)細(xì)菌等原核生物，利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)其轉(zhuǎn)錄的mRNA進(jìn)行測(cè)序分析，并結(jié)合已知的參考基因組信息，開(kāi)展基因表達(dá)定量、差異表達(dá)分析、功能注釋等研究的技術(shù)手段。它能高效解析原核生物在特定生理狀態(tài)、環(huán)境脅迫或發(fā)育階段下的基因表達(dá)調(diào)控規(guī)律。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
? 準(zhǔn)確性高：依賴已知的參考基因組，序列比對(duì)和基因注釋更可靠，減少假陽(yáng)性結(jié)果。
? 數(shù)據(jù)利用率高：特異性去除rRNA，高效富集mRNA，顯著降低 rRNA 污染，避免無(wú)效數(shù)據(jù)浪費(fèi)
? 鏈特異性文庫(kù)：可提供準(zhǔn)確的基因表達(dá)定量信息、精準(zhǔn)解析操縱子與轉(zhuǎn)錄邊界、鑒定反義RNA等調(diào)控因子、排除gDNA污染干擾
樣本要求
無(wú)致病性的細(xì)菌沉淀 | ≥200 mg；或?qū)?shù)期1ml菌液離心得到的沉淀 |
植物組織 | 總量≥2 μg，濃度≥50 ng/μL，體積≥40 μL |
檢測(cè)平臺(tái)
Illumina NovaSeq X Plus、DNBSEQ-T7
應(yīng)用方向
? 環(huán)境適應(yīng)機(jī)制研究：分析原核生物在極端環(huán)境（高溫、高鹽、重金屬）、營(yíng)養(yǎng)脅迫下的差異表達(dá)基因，揭示其耐逆相關(guān)的功能基因和調(diào)控通路。例如，研究大腸桿菌在饑餓條件下的碳代謝基因表達(dá)變化
? 病原菌致病機(jī)制解析：對(duì)比病原菌在感染宿主前后、毒力菌株與減毒菌株的轉(zhuǎn)錄組差異，篩選毒力基因、黏附相關(guān)基因等，闡明致病分子機(jī)制。例如，研究金黃色葡萄球菌在人體血液中的基因表達(dá)特征
? 抗生素耐藥性研究：分析耐藥菌株與敏感菌株在抗生素處理后的轉(zhuǎn)錄組變化，挖掘耐藥基因（如耐藥泵基因、靶標(biāo)基因突變相關(guān)基因）及耐藥調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
? 工業(yè)微生物改造：針對(duì)產(chǎn)酶菌、產(chǎn)抗生素菌等工業(yè)菌株，通過(guò)轉(zhuǎn)錄組分析篩選高產(chǎn)相關(guān)基因，指導(dǎo)菌株基因工程改造。例如，優(yōu)化放線菌的抗生素合成通路基因表達(dá)
案例應(yīng)用
1. Isolation and characterization of Pseudomonas fluorescens producing biogenic amines: AHL-mediated quorum sensing as a key regulatory mechanism.2025.LWT【IF=6.6】
2. Integrated induction of silver resistance determinants and production of extracellular polymeric substances in Cupriavidus metallidurans BS1 in response to silver ions and silver nanoparticles.2024.Chemosphere.【IF=8.1】
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