- 非靶標(biāo)代謝組學(xué)
- 脂質(zhì)組學(xué)
- 高通量靶標(biāo)代謝組學(xué)
- 多組學(xué)
-
蛋白質(zhì)組學(xué)
- 血清蛋白冠-DIA
- iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組研究
- 定性鑒定蛋白質(zhì)組學(xué)
- 多肽組學(xué)
- PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué)
- 磷酸化修飾DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- 乙酰化修飾DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- 泛素化修飾DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- 糖基化修飾DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- MetPro-Ⅱ代謝物與蛋白相互作用
- 4D-Label free非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組研究
- 蛋白冠-DIA
- DIA微量蛋白質(zhì)組
- Olink蛋白質(zhì)組學(xué)
- 乳酸化修飾DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- 琥珀酰化修飾DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- 軟件及儀器
- 單細(xì)胞&時(shí)空組學(xué)
產(chǎn)品介紹
真核無(wú)參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是針對(duì)沒(méi)有參考基因組或缺乏高質(zhì)量參考基因組的真核生物（如部分未完成基因組測(cè)序的動(dòng)植物、珍稀物種或特定菌株等）通過(guò)高通量測(cè)序（RNA-seq）進(jìn)行mRNA研究的技術(shù)，無(wú)需依賴參考基因組，直接進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本組裝和分析的技術(shù)手段。它通過(guò)構(gòu)建轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)庫(kù)，實(shí)現(xiàn)基因表達(dá)定量、差異分析及功能分析等研究目標(biāo)。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
? 適用性廣：無(wú)需依賴參考基因組，可對(duì)未完成測(cè)序的物種或基因組組裝質(zhì)量差的物種進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組研究，拓展了轉(zhuǎn)錄組學(xué)的應(yīng)用范圍
? 發(fā)現(xiàn)新基因：能直接捕獲物種特有的轉(zhuǎn)錄本或新基因，尤其適用于研究進(jìn)化地位特殊或未被充分研究的物種
? 低成本：避免了基因組測(cè)序的高昂成本，對(duì)于資源有限的研究對(duì)象更具可行性
樣本要求
動(dòng)物組織 | 實(shí)質(zhì)臟器組織≥50 mg（脂肪、皮膚、骨頭等RNA含量較低組織≥300 mg） |
植物組織 | 嫩葉根莖花果實(shí)≥200 mg；種子≥500 mg |
真菌菌體/菌絲 | ≥10?個(gè)/200mg |
檢測(cè)平臺(tái)
Illumina NovaSeq X Plus、DNBSEQ-T7
應(yīng)用方向
? 非模式生物研究：對(duì)珍稀動(dòng)植物、瀕危物種或小眾實(shí)驗(yàn)材料進(jìn)行基因表達(dá)分析，揭示其獨(dú)特的生物學(xué)特性（如極端環(huán)境適應(yīng)性、特殊代謝途徑）
? 基因組資源匱乏物種的初步探索：為后續(xù)基因組測(cè)序提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)（如基因序列、標(biāo)記信息），或直接用于功能基因挖掘
? 群體遺傳學(xué)研究：通過(guò)轉(zhuǎn)錄組SNP標(biāo)記分析種群遺傳結(jié)構(gòu)、適應(yīng)性進(jìn)化等（如不同地理種群的基因表達(dá)差異）
? 快速篩選候選基因：在缺乏參考基因組的物種中，快速鑒定與表型相關(guān)的差異表達(dá)基因（如作物的抗病性、果實(shí)品質(zhì)相關(guān)基因）
案例應(yīng)用
1. Programmed responses of different life-stages of the seagrass Ruppia sinensis to copper and cadmium exposure.2021.Journal of Hazardous Materials 【IF=14.22】
2. Compartmentalized 3D Tissue Culture Arrays under Controlled Microfluidic Delivery.2017.Scientific Reports【IF=3.9】
3. Ufd1-Npl4 Recruit Cdc48 for Disassembly of Ubiquitylated CMG Helicase at the End of Chromosome Replication.2017.Cell Reports【IF=6.9】
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